pada awalnya desa Putra Aji 1 adalah bagian dari desa Pakuan Aji.
Desa Pakuan Aji adalah desa yang mempunyai wilayah ± 8.920 Ha, dan terbagi menjadi beberapa dusun. Pada saat dipimpin oleh kepala desa Ismed Inonu dusun 10 semakin majunya dan pola piker yang semakin berkembang serta perekonomian yang semakin meningkat menjadikan masyarakat dusun 10 Putra Aji 1 ingin melakukan pemekaran desa. Bapak Mulyono sebagai kepala dusun 10 Putra Aji 1 mengumpulkan masyarakat dari berbagai elemen dan golongan guna membahas pemekaran desa. Karena ditinjau dari penduduk, sarana dan prasarana sudah memungkinkan kembali apabila menjadi desa yang berdiri sendiri. Selain daripada itu pemerintah Desa Pakuan Aji terlalu jauh dari Dusun 10 Putra Aji 1, jarak mencapai 15 Km sehingga birokrasi tidak efisien.
Melihat potensi yang dimiliki Dusun Putra Aji 1 kepala desa memberikan izin dan membantu moril dan materi guna mewujudkan cita – cita masyarakat Dusun 10 Putra aji 1 yang ingin Mandiri.
Pada tanggal 19 Februari 2005 dimulai dari awal musyawarah dusun 10 mulai membahas pemekaran desa. Kemudian tanggal 14 Maret 2005. Semakin antusias keinginan masyarakat dusun 10 Putra Aji 1 menjadi desa yang mandiri dan pada tanggal 27 Mei 2005 terjadilah pertemuan masyarakat yang ketiga serta selalu dihadiri tokoh – tokoh dari berbagai elemen masyarakat.
Pada tanggal 13 Agustus 2006 diadakan rapat bersama kepala dusun 10 dan tokoh masyarakat dusun Putra Aji 1 dengan anggota BPd Desa Pakuan Aji membahas rencana pemekaran desa dan mendapat respon positif dari BPD Desa Pakuan aji. Pada tanggal 27 Desember 2007 terbentuklah Desa Putra Aji 1 yang menjadi cita – cita masyarakat.